A zakynthosi repülőtér egy terminált használ, amely csak érkezési és indulási terminálokra van felosztva, mindkettő a földszinten. A terminál viszonylag kicsi, körülbelül 150 méter hosszú, és a bejárattól a repülőgépekig legfeljebb 80 métert kell gyalogolni.
Olcsó Hotelek Zakynthos repülőtér közelében
A tájékozódás itt nagyon egyszerű, és lehetetlen eltévedni. A nyári szezonban azonban a repülőtér általában zsúfolt, és készüljön fel arra, hogy a check-in pultoknál és a biztonsági ellenőrzőpontoknál sorban állni kell (egyes esetekben akár 45 percet is).