Pisában van egy kis terminál, amely nyáron általában zsúfolt. Ezért érdemes nagyobb tömegre és akár 30 perces sorban állásra számítani a biztonsági ellenőrzéseknél. A bejárattól a kijáratig a repülőgépekig nagyon rövidek a távolságok.
Olcsó szállodák a pisai repülőtér közelében
A repülőtéri terminál csak egyszintes, az induló járatok a jobb oldalon, az érkező járatok pedig a bal oldalon találhatók.
A biztonsági ellenőrzés után egy éttermekkel és a schengeni övezetbe vezető indulási kapukkal ellátott területre érkezik, majd az útlevél-ellenőrzés és a nem schengeni országokba tartó járatok kapui következnek.