Chania egyetlen kisebb, modern megjelenésű terminált használ, amely nagyon könnyen navigálható. A repülőgépekhez rövidek a távolságok, a nyári szezonban nagyobb tömegre számítson a viszonylag kis területen.
Hotelek megtekintése Chania városában
A schengeni övezetbe érkező és onnan induló járatokra a bejelentkezés egy közös csarnokban történik. A kiosztás a közös biztonsági ellenőrzés után történik, egyes kapuk az útlevélellenőrzés után, míg mások nem.
Az indulási és érkezési csarnokok a földszinten vannak.
A repülőtér az utolsó és az első érkezők között zárva tart, általában 4:00 és 0:00 óra között tart nyitva.